En el Año 101 de la era A.G., unos seres misteriosos, conocidos en ese entonces como “UE” atacaron y destruyeron una colonia espacial llamada Ángel. Este brutal ataque pasa a ser conocido en la historia como “El Día en que el Ángel Cayó”, y marca el inicio de “La Guerra de los Cien Años”. La serie comienza en el año 108 de la era A.G. cuando los “UE” atacan la colonia espacial “Ovan”, lugar donde Flitt Asuno y su madre han vivido después de haber escapado de la colonia Ángel antes de su destrucción. La madre de Flitt es mortalmente herida durante el ataque de los “UE”, pero antes de morir ella le entrega a su hijo un objeto llamado “Dispositivo AGE”, un aparato que contiene los planos de una poderosa arma del pasado: el antiguo mesías llamado “Gundam”.

Flitt se pasa los próximos años de su vida estudiando ingeniería y diseñando al Gundam AGE-1 a partir de los planos contenidos en el “Dispositivo AGE”. Siete años después, Flitt completa al Gundam AGE-1 Normal justo cuando los “UE” atacan la colonia espacial Nora, y hace uso de él para ayudar a la nave de combate “Diva” a evacuar a los ciudadanos de la colonia antes de que se destruya. Flitt quiere luchar contra los UE por haberle destruido su hogar dos veces y decide unirse al equipo de mobile suits de la nave “Diva” como piloto del Gundam.