Akatsuki, organización que tiene entre sus filas a los ninjas más peligrosos, ataca Konoha una vez más, aunque Naruto y sus compañeros logran pararles los pies. Al llegar a la villa las familias de todos ellos los felicitan por su gran trabajo, excepto la de Naruto, pues no tiene a nadie esperándolo. Esa misma noche, y durante una cita con Sakura, Tobi/Madara se presenta ante ellos y los ataca con un dōjutsu que les hará ver las cosas de una manera muy distinta.